خطرات بهداشتی قابل توجهی در استفاده از فاضلاب تصفیه نشده برای آبیاری مزارع سبزی و باغ‌های میوه وجود دارد.
فاضلاب‌های شهری می‌توانند شامل مخلوطی از آلودگی‌های بیولوژیکی و شیمیایی باشند. فاضلاب شهری حاوی مقادیر زیادی فلزات سنگین و سمی است.
فلزات سنگین با توجه به ثبات شیمیایی، تجزیه‌پذیری ضعیف و داشتن قدرت تجمع زیستی در بدن موجودات زنده به سرعت تبدیل به آلاینده‌های سمی می‌شوند.

رئیس انجمن علوم وصنایع غذایی ایران اعلام کرده است: آبیاری با آب فاضلاب، سبزیجات را آلوده و می‌تواند ناقل انواع بیماری‌ها و میکروب‌ها در بدن باشد.

 
 آبیاری با آب فاضلاب‌های شهری در منطقه جنوب پایتخت، در طی چند سال اخیر توجه بسیاری از مسئولان وزارت بهداشت با به خود جلب کرده است بر این اساس استفاده از آبهای آلوده فاضلاب‌ها ممنوع و غیر قانونی است و وزارت بهداشت با افراد خاطی برخورد می‌کند.

سبزیجات آ‌بیاری شده با آب فاضلاب‌های شهری آلودگی‌های میکروبی و شیمیایی را جذب خود نموده و بیماری‌های مختلف را به بدن انسان منتقل می‌کند.

 آب فاضلاب‌ها حامل انواع میکروب‌ها به مواد شیمایی فلزی مانند سرب، جیوه و ... است که سلامت انسان را تهدید می‌کند بنابر این احتمال ابتلا به بیماری‌های وبا، میکروبی و عفونی و... وجود دارد.
 ضد عفونی کردن سبزیجات آلوده با مواد ضدعفونی کننده تا حدی میکروب‌های موجود را از بین می‌برد، اما تأثیری در کاهش میزان مواد شیمیایی فلزی درسبزیجات ندارد چرا که سرب جذب بافت‌های گیاه شده و آن را به طور کلی آلوده می‌کند.

 تشخیص سبزیجات آلوده از طریق علائم ظاهری سبزیجات امکان پذیر نیست وتأثیری در انتخاب سبزی مناسب و سالم ندارد بنابر این به مردم هشدار داده می‌شود سبزیجات مطمئن را خریداری و قبل از مصرف ضد عفونی کنند.